ADNr 16S

Définition

Le gène ADNr 16S permet la synthèse de l’ARNr (ribosomique) 16S qui fait partie de la petite sous-unité du ribosome. Cet ARNr intervient dans la reconnaissance des ARNm durant la synthèse des protéines ainsi qu’à la structure du ribosome.

Schéma d'un ribosome contenant l'ARNr 16S.
L’ARNr 16S est synthétisé (lors de la transcription) à partir du gène correspondant. Cet ARNr peut ensuite participer à l’assemblage du ribosome avec les deux autres ARNr (5S et 23S) ainsi que des protéines.

Le gène de l’ARNr 16S en phylogénie moléculaire

Outre sa fonction biologique, la séquence de ce gène est aussi utilisé en biologie moléculaire comme marqueur taxinomique. Ce gène possède des régions variables qui permettent de différencier et de classer les bactéries. En comparant la séquence de ce gène avec ceux de bactéries connues, il est possible de classer et d’identifier une bactérie.

Avantage

– Il est présent chez toutes les bactéries

Inconvénients

– Certaines bactéries peuvent posséder en même temps plusieurs gènes d’ADNr 16S différents, ce qui complique leur identification.

– Des contamination avec les ADNr des chloroplastes sont possibles dans l’environnement.

-À partir de la séquence de ce gène, il n’est pas possible de déterminer les caractéristiques d’une bactérie. On peut seulement émettre des hypothèses par rapport à ce qui est connu pour des bactéries avec une séquence d’ADNr 16S proche.

Bibliographie

Woese, C. R., Kandler, O., & Wheelis, M. L. (1990). Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 87(12), 4576–4579. https://doi.org/10.1073/pnas.87.12.4576 (lien)

Yarza, P., Yilmaz, P., Pruesse, E., Glöckner, F. O., Ludwig, W., Schleifer, K. H., Whitman, W. B., Euzéby, J., Amann, R., & Rosselló-Móra, R. (2014). Uniting the classification of cultured and uncultured bacteria and archaea using 16S rRNA gene sequences. Nature reviews. Microbiology, 12(9), 635–645. https://doi.org/10.1038/nrmicro3330 (lien)