Définition
Le gène ADNr 16S permet la synthèse de l’ARNr (ribosomique) 16S qui fait partie de la petite sous-unité du ribosome. Cet ARNr intervient dans la reconnaissance des ARNm durant la synthèse des protéines ainsi qu’à la structure du ribosome.
Le gène de l’ARNr 16S en phylogénie moléculaire
Outre sa fonction biologique, la séquence de ce gène est aussi utilisé en biologie moléculaire comme marqueur taxinomique. Ce gène possède des régions variables qui permettent de différencier et de classer les bactéries. En comparant la séquence de ce gène avec ceux de bactéries connues, il est possible de classer et d’identifier une bactérie.
Avantage
- Il est présent chez toutes les bactéries
Inconvénients
- Certaines bactéries peuvent posséder en même temps plusieurs gènes d’ADNr 16S différents, ce qui complique leur identification.
- Des contamination avec les ADNr des chloroplastes sont possibles dans l’environnement.
-À partir de la séquence de ce gène, il n’est pas possible de déterminer les caractéristiques d’une bactérie. On peut seulement émettre des hypothèses par rapport à ce qui est connu pour des bactéries avec une séquence d’ADNr 16S proche.
Bibliographie
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