Pouvoir nommer et classer correctement une bactérie est important pour faciliter la recherche scientifique. Dans le cadre médical, il est aussi intéressant que des chercheurs, médecins, pharmaciens nomment les bactéries de la même façon pour éviter des confusions. Ce classement est appelé taxonomie.
Comment nommer une bactérie de façon scientifique ?
Les bactéries sont généralement appelées par le nom de genre et d’espèce. Les deux sont écrits en italique (ex : Escherichia coli). Le nom de genre est toujours écrit avec une majuscule et peut être abrégé avec sa lettre initiale (ex : E. coli). Un nom de souche peut être ajouté après le nom d’espèce (ex : E. coli BL21). Le nom d’espèce peut être remplacé par l’abréviation sp. (species) lorsque la bactérie n’a pas encore été décrite.
Nom vernaculaire
Les bactéries peuvent aussi être nommées par un nom vernaculaire (ou commun). Ces noms font partie du langage courant. Ils sont moins précis que la nomenclature scientifique. Par exemple, Escherichia coli est également appelé colibacille tandis que Staphylococcus aureus est nommé staphylocoque doré.
Donner un nom à une nouvelle bactérie
Lors de la découverte d’une nouvelle bactérie, les scientifiques peuvent proposer un nom pour celle-ci. Une liste officielle regroupe l’ensemble des noms de bactéries. Ces noms sont soumis à un ensemble de règles définies par le comité international de systématique des procaryotes (International Committee on Systematics of Prokaryotes ; ICSP). La description de nouvelles bactéries se fait généralement dans le journal scientifique International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology.
Changement de nom
Selon l’avancement des recherches scientifiques, la nomenclature des bactéries peut évoluer.
Candidatus
Le terme “Candidatus” peut être ajouté en amont du nom binomiale d’une espèce bactérienne dont il manque des informations pour une description officielle. Cela est notamment utilisé avec des bactéries pour lesquelles on possède des informations sur le mode de vie mais que l’on n’arrive pas encore à cultiver. Dans ce cas, seul le mot “Candidatus” est écrit en italique tandis que le reste du nom est écrit droit sans italique. Par exemple “Candidatus Midichloria mitochondrii”.
Référence bibliographique
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