Identifier des micro-organismes à partir de leur ADN ?
L’ADN peut être considéré comme une carte d’identité propre à tous les êtres vivants. Il peut donc servir à identifier les organismes vivants. Il s’agit d’une méthode rapide pour identifier des micro-organismes comparées aux méthodes « classiques » de culture et phénotypage.
Identification avec des gènes marqueurs taxonomiques
Il est possible d’identifier certains micro-organismes uniquement en séquençant un (ou plusieurs) gène considéré comme un marqueur taxonomique.
Le gène de l’ADNr 16S est souvent utilisé comme marqueur taxonomique pour identifier les bactéries.
Exemple d’utilisation
– Identification des bactéries associées à des crustacés
– Identification des bactéries présentes sur des débris en plastiques flottant